Quatrième palais minoen de Crète par sa taille, Kato Zakros fut la résidence permanente de la famille royale, ainsi que le centre administratif, commercial et religieux de la région. Sa situation en fit la principale porte commerciale vers le Moyen-Orient. Un premier palais avait été bâti vers 1900 av. J.-C., mais les ruines que l'on visite sont celles d'un second complexe, reconstruit vers 1600 av. J.-C. et détruit vers 1450 av. J.-C., probablement recouvert par une éruption volcanique.