Sur les hauteurs de la ville, au pied des Santa Ynez Mountains, cette mission, surnommée la « reine des missions » et dont la communauté est toujours active, fut fondée en 1786, deux ans après la mort de Junípero Serra, qui aurait bien voulu la bâtir plus tôt ; le gouverneur, inquiet de la puissance des missionnaires, s'occupa d'abord du Presidio. L'église, très imposante, abrite un intérieur de style mexicain très coloré. Le musée est consacré à l'histoire de la mission et aux Indiens chumashs.