Mails et quinconces de tilleuls ont été plantés en terrasses au 18e s. Enclavé dans ce jardin, le Potager du Roy présente les aliments embarqués sur les navires, les plantes médicinales emportées par les chirurgiens de marine et du lin, du chanvre pour fabriquer les voiles des bateaux ou les cordages. À l'origine, il s'agissait d'un jardin botanique destiné à l'instruction des élèves de l'école de médecine navale ; il fournissait également de la pharmacopée pour l'hôpital.