C'est dans l'ancien ermitage que saint François subit une opération des yeux, et c'est dans la grotte qu'après 40 jours de jeûne, il édicta la règle franciscaine. La chapelle de la Maddalena (12e s.) est ornée de fresques où apparaît le « T », emblème de la croix dessiné par le Poverello. La chapelle San Michele, la grotte, le tronc d'arbre où Jésus apparut au saint, l'ancien ermitage et l'église du 15e s. composent ce haut lieu du franciscanisme.