Après cinq années de travaux, le musée a rouvert en 2019 dans des espaces restructurés et une nouvelle scénographie, plus contextuelle. Les oeuvres proviennent du complexe monumental de la place des Miracles. S'en détachent Bonanno Pisano, qui a réalisé la célèbre porte de San Ranieri du transept droit de la cathédrale, Nicola et Giovanni Pisano (bustes de la loggia du baptistère), Tino di Camaino et Nino Pisano, sculpteurs de tombeaux. Giovanni Pisano signa aussi la Vierge sculptée du trésor.