Les archéologues découvrirent en 1997 trois églises, deux puits et trois citernes. On identifia avec certitude le village de Béthanie « au-delà du Jourdain où Jean baptisait » (Jean 1-28). La partie principale du site est une colline appelée Tell Mar Elias, d'où Elijah fit son ascension au paradis et où s'installa la première colonie de saint Jean-Baptiste, au 1er s. de notre ère. À 2,7 km plus à l'ouest se trouve la deuxième partie du site avec l'église de St-Jean, et 300 m plus loin, le lieu du baptême à proprement parler. Les constructions datent pour la plupart des 5e et 6e s.