Fondé en 1836 dans l'ancienne caserne des arquebusiers, entièrement rénové, le lieu interroge sur les enjeux de la biodiversité et la fragilité de l'environnement. Géologie régionale et animaux naturalisés placés dans de belles reconstitutions de leur milieu naturel (dioramas) sont à l'honneur. Sont présentés les principaux écosystèmes de la Côte d'Or, mais aussi ceux d'autres parties du monde. Enfin, des projections de films sous le dôme de 10 m du planétarium explorent l'univers entier.