Ses 7 000 m2 abordent de façon didactique ce que fut l'activité maritime, commerciale et industrielle du port de Bilbao. Le rez-de-chaussée se concentre sur le développement de la ría au 19e s. Prenez le temps de contempler l'épave d'Urbieta (15e s.) mise au jour en 1998 dans l'estuaire de Guernica. Le second niveau présente Bilbao sous son aspect port de commerce, port industriel et chantier naval (photos, maquettes, cartographie et films documentaires à l'appui). Quelques bateaux sont ouverts à la visite, à l'extérieur du musée.