Ce jardin fut créé au 17e s. à la demande des pharmaciens et des médecins d'Amsterdam, désireux de faire mettre en culture les plantes médicinales rapportées par la Compagnie des Indes. Aujourd'hui, malgré sa petite taille, le jardin rassemble près de 4 000 plantes, réparties le long des allées, dans la palmeraie et dans la belle « Maison des trois climats ».